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常见问题

如何计算gRNA特异性分值?

VectorBuilder使用的gRNA设计和评分规则与张峰实验室开发的运算规则类似。简而言之,对于每个物种,我们找出符合N(20)NGG规则的靶序列,把错配碱基 ≤3的序列列为潜在的脱靶位点,计算出每个gRNA的脱靶分值,进而得出最终的gRNA特异性分值。gRNA特异性分值在0-100之间,分值越大靶向特异性越高。

请注意特异性分值只是一个参考值。实际的靶向效率和特异性可能会与预测的分值有偏差,低分值的gRNA也可能有较好的靶向效果。