文库构建的一般流程
文库设计
Oligo合成
文库克隆
NGS验证
文库病毒包装
体外或体内筛选
功能筛选样品的
NGS测序分析

文库设计
设计一个优化后的文库对于筛选实验的成功至关重要。我们的技术团队可以为您设计具有高效且无差错克隆特点的文库载体,其中可包含各种合适的筛选标记或barcode序列,并且可产出具有高信噪比特征的稳定结果。根据您的研究需求,您可以选择我们的各种经过验证的基因递送系统,比如慢病毒、AAV、转座子、常规质粒和腺病毒。
对于CRISPR和RNAi功能筛选,如果您需要帮助针对您的基因组靶基因设计gRNA或shRNA序列,我们可以基于我们强大的计算机资源和优化流程为您设计。对于双载体系统的CRISPR文库,我们还可以根据您的筛选策略,设计和构建相应的Cas9或Cas9变体表达载体。
预制质粒DNA文库的扩增
为获得插入目的载体骨架的DNA变异体,我们可以使用从头合成、定向进化或以上方法的组合。变异体最少通过一轮PCR扩增并同时以高覆盖率克隆到目的载体骨架中。将文库质粒DNA转化大肠杆菌进行扩增培养后,取对数生长期的菌液制备成甘油菌进行保存。为了评估文库的覆盖率和均一性,在病毒包装之前对文库质粒进行NGS分析。
文库病毒包装
您可能需要通过病毒(如慢病毒或腺相关病毒)将文库转到细胞中。我们研发出了一系列专利技术和试剂,大大改进了病毒包装的滴度、纯度、活性和均一性等。我们可为您的筛选实验在短周期内提供提供预制的病毒文库。
了解更多病毒包装服务信息 体外或体内筛选
高通量文库筛选利用多种分析方法高效筛选适用于广泛类型的文库,如功能分析、药物开发的靶标鉴定、通路分析以及遗传标记和表型检测等多种应用。我们的技术团队可提供多样化的筛选方案,涵盖细胞水平和体内实验,根据您的具体研究需求定制服务,包括细胞活力/存活筛选、耐药性筛选、通路筛选、基于靶点的筛选、毒性筛选,以及围绕特定研究目标设计的定制筛选方案。
功能筛选样品的NGS测序分析
功能筛选后,您可以直接将基因组DNA样品寄送给云舟生物,我们将为您制备NGS文库、高通量测序和数据分析,并在短短几周内告知您样品的精确读取计数(read counts)。